升级R一直是一件痛苦的事情,所以还是记录一下
1.下载最新R,根据Mac芯片选择
2.安装之后打不开R
3.终端输入which R,打开路径(/Library/Frameworks/R.framework/Versions),修改之前的R版本文件夹为最新版本,如4.2—4.4
4.修改R包路径,.libPaths(), 加入之前的R包路径
5.运行以下代码,更新
update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)
6.升级Bioconductor
options("repos") #查看当前下载源
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN"))
BiocManager::install(version = "3.20")